前沿对话翟少伦博士保育猪病毒

年8月5日,广东省农业科学院动物卫生研究所动物疫病诊断中心魏文康团队——翟少伦博士以第一作者在国际知名病毒学刊物《VirologyJournal》上发表猪丁型冠状病毒相关论文“OccurrenceandsequenceanalysisofporcinedeltacoronavirusesinsouthernChina”,该刊物是SCI收录期刊,年影响因子为2.。

论文主要内容如下:年,猪丁型冠状病毒(PDCoV)首次在香港发现。年,PDCoV首次在美国的患腹泻仔猪粪便中得以分离,此后,我国一些省份也报道了该病毒的流行。但其在华南地区的流行现状仍不清楚。华南地区是我国生猪养殖及猪肉消费重要地区。调查其流行以及比较其与传统病毒腹泻病原(猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒和猪C型轮状病毒)的流行情况,有助于我们防控生猪养殖过程中发生的病毒性腹泻疫病。在本研究中,我们收集了15个猪场(分别来自广东、广西、海南)的份临床腹泻样本,并进行了RT-PCR检测。PDCoV主要集中在保育猪,检出率为1.28%(5/),并且PDCoV阳性样本均为年采集样本,而年至年的份存档样本均为PDCoV阴性。此外,相对于猪传染性胃肠炎病毒(1.54%,5/)和猪C群轮状病毒(1.28%,6/)低的流行,PEDV的检出率(22.6%,88/)较高。值得一提的是,5份PDCoV阳性样本中还都检出有PEDV的混合感染。进一步对PDCoV的S基因和N基因进行克隆和分析,获得的5株PDCoV的S基因和N基因全长为bp和bp。5株PDCoV华南株S基因比美国株、韩国株、个别泰国株和国内株的S基因缺失3个碱基。遗传进化分析也表明,PDCoV华南株在一个小分支上,而与美国株、韩国株、泰国株遗传距离较远(图1和图2)。该研究证实了PDCoV在华南地区的存在,并得出了PDCoV华南株在遗传进化上具有一定的地域局限性。

图1PDCoV与其他冠状病毒的S基因遗传进化分析

备注:本研究提及的PDCoV毒株被左箭头标出;中国株、美国株、南韩株和泰国株分别用“■”,“●”,“?”和“▲”标记;加“﹡”冠状病毒毒株的收集日期不详。

图2PDCoV与其他冠状病毒的N基因遗传进化分析

备注:本研究提及的PDCoV毒株被左箭头标出;中国株、美国株、南韩株和泰国株分别用“■”,“●”,“?”和“▲”标记;加“﹡”冠状病毒毒株的收集日期不详。

当前,猪场病毒性腹泻较为复杂,一方面,PEDV的变异引发的免疫失败,传统腹泻病依旧发生;另一方面,猪丁型冠状病毒、猪博卡病毒、猪库布病毒等新的腹泻性病原的出现,无疑给原本就很难解决的“仔猪病毒性腹泻问题”雪上加霜。年以来,根据本中心的监测情况,猪博卡病毒、猪库布病毒等的感染较为严重。基于我省的天气原因,建议做好传统腹泻病疫苗免疫的同时,唯有做好产床、保育猪舍等的环境卫生(通风、干燥等),丰富营养,提高仔猪的非特异性免疫力,才能使仔猪病毒性腹泻造成的损失降到最低。

目前,尽管猪丁型冠状病毒在华南地区具有很低的检出率,并且病毒进化存在地理限制性,表明该病毒还没有大范围暴发流行,种猪场应加强病原检测,淘汰阳性猪只,为客户提供更加健康的仔猪。

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